La bandera es, en suma, un extracto del escudo ya que guarda con ellos íntima relación en los colores y el contexto. Está confeccionada con los colores: Azul, amarillo y verde.

Explicación de la bandera:

El azul indica la riqueza hidrográfica de los lugares donde están ubicados las sedes de la institución, simboliza las semillas de los valores que se enseñan y el agua con que se riega y crece.

 El amarillo indica la riqueza de la tierra y la fuerza de su gente, la capacidad de replantear lo aprendido para el beneficio de las comunidades.

 El verde alude a la ubicación geográfica de la Institución Educativa, con los valores y tradiciones del pueblo antioqueño (Ambiente, color de la bandera antioqueña) simboliza las motivaciones, la frescura y la lozanía del campo siempre verde.